Łysienie plackowate to choroba autoimmunologiczna, co oznacza, że system immunologiczny chorego w wyniku zaistniałej dysfunkcji “pomyłkowo” atakuje zdrowe mieszki włosowe, uważając je za intruza z zewnątrz. Naukowcy nie są jeszcze w stanie jednoznacznie określić, co powoduje tę dysfunkcję układu immunologicznego, która objawia się u chorych jako łysienie plackowate: czy zapalnikiem dla tej choroby są procesy zachodzące wewnątrz ciała chorego (wirusy, bakterie), czy jest to jakiś czynnik zewnętrzny, czy też może jest to kombinacja czynników wewnętrznych i zewnętrznych?